কুষ্টিয়া সুগার মিলের যাত্রা শুরু হয় ১৯৬৫-৬৬ অর্থবছরে। প্রতিষ্ঠার পর কয়েক বছর লাভজনক অবস্থানে থাকলেও নব্বই দশকের পর থেকে ধারাবাহিক লোকসানের মুখে পড়ে প্রতিষ্ঠানটি।