সাতক্ষীরার ভোমরা শুল্ক স্টেশনকে পূর্ণাঙ্গ কাস্টমস হাউস হিসেবে ঘোষণা দেওয়ার দুই মাস পেরিয়ে গেলেও এখনো কমিশনার নিয়োগ না হওয়ায় বন্দরের কার্যক্রমে স্থবিরতা দেখা দিয়েছে। ফলে বন্দরের সক্ষমতা বাড়ানো যাচ্ছে না এবং স্বাভাবিক কার্যক্রমও ব্যাহত হচ্ছে।